Una investigación realizada desde la Corporación Universitaria del Huila, demostró que a la altura del Neiva, el río Magdalena contiene gran cantidad de microplásticos.
En 2021, la autoridad ambiental de la ciudad abrió 355 procesos sancionatorios por presunto incumplimiento de la norma en materia de vertimientos, lo que afecta el río Bogotá.